1、配制清洗液
將藥劑加入潔凈的水中，且配制用水要是除去硬度、過度金屬和余氯的RO產品水或去離子水。確認溶液要混和均勻，并且把溫度和PH調到所需要的值。
2、低流量輸入清洗液
先用清洗水泵混合一遍清洗液，預熱清洗液時應以低流量。然后以盡可能低的清洗液壓力置換元件內的原水，其壓力需達到使得補充進水至濃水的壓力損失就可。
3、循環
當原水被置換掉后，濃水管路中就應該出現清洗液，讓清洗液循環回清洗水箱并確認清洗液溫度恒定。
4、浸泡
停止清洗泵的運行，讓反滲透設備膜元件浸泡在清洗液中。有時元件浸泡1小時，但對于頑固的污染物，需要增加浸泡時間。
5、高流量水泵循環
循環30～60分鐘以后，用高流量沖洗污染物。在高流量條件下，將會出現過高壓降的問題，反滲透設備單元件允許的壓降為１bar，對多元件壓力容器允許壓降為35ba。
6、沖洗
用清潔水進行低壓沖洗，沖洗系統內的清洗液可以用預處理的合格產水，除非存在腐蝕問題。
